Незначительные герпетические высыпания возможны через некоторое время после лечения, затем должна последовать длительная ремиссия ( если конечно не будет предпосылок для активации вируса - стресс, снижение иммунитета по каким либо причинам)

Антитела к CMV и HSV никуда не денуться, ПЦР будет их определять, вопрос только в каком титре они будут присутствовать в крови.
К сожалению и цитомегаловирус, и вирус герпеса это хронические персистирующие инфекции, которые невозможно эрадицировать из организма. Борьба идёт только за длительность ремисии при этих заболеваниях.
То что у вас через месяц случилось обострение герпесвирусной инфекции - это печально, но "везёт" не всем. Большинство пациентов находятся в ремиссии после курса ферровира от 3-х до 6-9 месяцев. Кому как "повезёт". Точно прогнозировать индивидуальный иммунный ответ конкретного пациента, на современном этапе развития медицины,невозможно в принципе. Можно говорить только о вероятном иммунном ответе на препарат.
На ацикловир (валвир, валтрекс) вы тоже не отвечаете, хотя это не иммуномодулятор, а противовирусный препарт прямого действия, который обязан давать эффект у всех.