Генетическое разнообразие влияет на разнородность количества лейкоцитов

Этническая разнородность количества лейкоцитов зависит от различных генетических вариантов, согласно результатам 3 больших геномных исследований ассоциаций (GWAS), опубликованных он- лайн в «Public Library of Science» от 30 июня.

Отдельные исследования количества лейкоцитов, проведенные у 14 792 японцев, 16 388 афроамериканцев, и 19 509 белых участниках, так же как в дополнительных когортах, обнаружили некоторые генетические варианты, затрагивающие общее количество лейкоцитов, и влияющие на некоторые подтипы лейкоцитов, такие как лимфоциты, нейтрофилы, базофилы, эозинофилы или моноциты.

Японское исследование обнаружило 9 GWAS-существенных ассоциаций между генетическими локусами и количеством лейкоцитов, и подтвердило 3 локуса, уже известные, как влияющие на количество лейкоцитов. Недавно идентифицированные локусы включают CDK6, затрагивающий количество нейтрофилов; STXBP6, ITGA4, и MLZE локусы и область главного комплекса гистосовместимости, влияющие на количество моноцитов; и ERG, NAALAD2, GATA2, и SLC45A3-NUCKS1 локусы, затрагивающие количество базофилов.

Ранее определенными локусами были PSMD3-CSF3 (нейтрофилы) и HBS1L-MYB (эозинофилы); GATA2, влияющий на количество эозинофилов, так же как и количество базофилов; и область главного комплекса гистосовместимости, которая значительно затрагивает эозинофилы, так же как и моноциты.

Сравнивая японскую популяцию с белой, варианты во всех 12 локусах показали те же самые направленные эффекты, и 4 локуса (ITGA4 для моноцитов, GATA2 для эозинофилов и базофилов, и PSMD3-CSF3 для нейтрофилов) показали GWAS-значительную ассоциацию.

Особенно интересным было то, что ITGA4 кодирует для веществ, которые опосредуют миграцию лейкоцитов, STXBP6 вовлечен в процесс мембранного сплава, включая фагоцитоз, и GATA2 играет роль в гематопоэзе, особенно базофилов и эозинофилов. Это исследование не обнаружило существенных генетических ассоциаций с количеством лимфоцитов.

Черное популяционное исследование состояло из 7 когорт «Continental Origins and Genetic Epidemiology Network». Авторы объяснили, что общее количество лейкоцитов, и количество нейтрофилов в частности типично – от 10 %до 20% ниже у афроамериканцев, чем у представителей белой расы. Это различие было приписано варианту DARC , часто встречающемуся в Африке, которая обеспечивает селективное преимущество в малярийных областях и влияет на продукцию и перемещение нейтрофилов.

Мягкая нейтропения, определенная как абсолютное количество нейтрофилов меньше чем 1,56 × 109 клеток/л в повторных случаях, найдена в 40 % популяций африканского происхождения, и приблизительно 5 % афроамериканцев африканского происхождения, живущих в Америке, но меньше чем у 1 % белых американцев европейского происхождения. Авторы предполагают, что характеристика вариантов, связанных с количеством лейкоцитов и нейтрофилов, может «помочь в клинических подходах к связанной с раком нейтропенией или гематопоэтической мобилизации стволовых клеток».

Исследование идентифицировало дополнительную генетическую область, которая значительно влияет на количество лейкоцитов: вариант в CXCL2 кодирует цитокин, затрагивающего полиморфноядерные лейкоциты (нейтрофилы, эозинофилы, базофилы). Эта ассоциация была идентифицирована у выходцев из Латинской Америки, а также в белых и японских популяциях.

Исследуя локусы, идентифицированные в японском популяционном исследовании и белом популяционном исследовании, черное популяционное исследование также подтвердило влияние CDK6 и области PSMD3-CSF3. Таким образом, в дополнение к DARC, у 3 областей, как в настоящее время известно, есть GWAS-существенные ассоциации с количеством лейкоцитов в черных популяциях.

Третье исследование на белых нашло множество локусов, имеющих GWAS-существенную ассоциацию с количеством лейкоцитов. Данные более чем 19 000 людей были проанализированы в стадии открытия, и еще 11 823 в дублировании, обнаружив, что 10 областей, значительно ассоциируются с общим количеством лейкоцитов, и 5 с определенными подтипами лейкоцитов, были «распространены через семь геномных локусов». Только 3 из этих ассоциаций были ранее известны.
Это исследование идентифицировало много локусов в области, а не как определенные гены; например, места, связанные с полным количеством лейкоцитов были «6p21 в области HLA, 17q21 около ORMDL3, и CSF3». Во всех 10 областях гены в пределах 100 КБ самого существенного варианта были потенциальными кандидатами. Особенно, ассоциации были обнаружены около ORMDL3 и CSF3 для полного количества лейкоцитов и количества нейтрофилов. Варианты генов-кандидатов в нескольких из этих локусов (ITGA4, GATA2, и область MHC на хромосоме 6, который содержит связанные с лимфоцитами гены HLA) также значительно ассоциировались с количеством лейкоцитов и/или их подтипов в японском исследовании.

Новые результаты должны «поспособствовать нашему пониманию генетических факторов, лежащих в основе изменения количества лейкоцитов в пределах и между популяциями, и выдвинут на первый план важность общих генетических вариантов в геномных областях, кодирующих хемокиновые лиганды и рецепторы к регулированию миелопоэза, и количества циркулирующих лейкоцитов в человеческих популяциях», - пишут авторы черного исследования.


Источник: Abbottgrowth.ru